
Jedna od najatraktivnijih prirodnih obeležja grada je zaliv „La Konča“ ili „Školjka“ sa karakterističnim potkovičastim oblikom i prelepom plažom. U njegovom centru je ostrvo Santa Klara. Sa jednog kraja uzdiže se brdo Igeldo, a sa drugog brdo Urgul, od kojih je svaka ukrašena skulpturama Eduarda Čilide (1924-2002), svetski poznatog umetnika rođenog i umrlog u Donostiji, muzej njegovih dela je nalazi se u Hernani, selu 9 km od Donostije. San Sebastijan takođe prolazi kroz reku Urumea, koja deli Stari grad na dva dela pre nego što se uliva u Kantabrijsko more.